Bioinformata

Projeto desenvolvido: Identificação por phage display de candidatos vacinais para esquistossomose mansônica baseada na auto-cura de macacos rhesus (Macaca mulatta).

Neste projeto foi desenvolvido uma ferramenta de bioinformática capaz de identificar enriquecimento de peptídeos capturados pela técnica PhIP-Seq (phage immunoprecipitation sequencing). Os modelos de distribuição de Poisson generalizado com zeros inflacionado (ZIGP) e binomial negativa foram ajustados aos dados de sequenciamento da técnica para identificar proteínas antigênicas relacionados a auto cura de macaco rhesus frente a uma infecção por S. mansoni, agente etiológico da esquistossomose. Com esta ferramenta, foi possível analisar os dados de enriquecimento e encontrar um conjunto de proteínas candidatas para a criação de uma vacina contra esquistossomose.

Atividades desenvolvidas:

Desenvolvimento e aplicação de pipelines de bioinformática para análise de dados de sequenciamento
Desenvolvimento de scripts em Shell
Análise de Dados em larga escala
Aplicação de métodos de aprendizagem de máquina
Modelagem estatística
Elaboração de relatórios científicos e Discussão de dados e resultados em grupo